飞行器工程学院是在原机械工程系、航空与机械工程学院的基础上逐步发展建立起来的。2009年6月，根据学校学科发展及专业设置的需要，由原航空与机械工程学院 “飞行器设计工程系”、“飞行器动力工程系”、“飞行器制造工程系”的航空维修技术与工程方向、大学生航空文化教研部和原土木建筑学院“力学教研部”、“力学实验中心”、“ 实验力学研究室”组建而成。

学院现有专职教职工71人，专任教师57人，其中江西省“赣鄱英才555”工程人才1人，省百千万人才3人，省级学科带头人3人，省级教学名师2人，省级骨干教师7人，硕士生导师18人，教授10人，副教授(高级工程师)12人，博士25人， 硕士27人。另有双聘中国工程院院士1人，柔性引进“赣鄱英才555”工程人才1人，兼职教授十余人;在校本科生1100余人，硕士研究生90余人。

学院现有飞行器设计工程系、飞行器动力工程系、飞行技术系、航空维修工程系、大学生航空文化教研部、力学教研部、实验力学研究室、力学实验中心和飞行器综合实验中心、无人机研究所等六个系(部)、一个研究室、二个实验中心、一个研究所。其中“飞行器动力工程”为国家级专业综合改革试点专业，“航空维修工程”为国防紧缺专业，力学实验中心为江西省示范实验中心。

学院现有飞行器设计与工程、飞行器动力工程、飞行器制造工程(航空维修技术与工程专业方向)、飞行技术四个本科专业;有飞行器设计、航空宇航推进理论与工程、工程力学、人机与环境工程、航空噪声与振动工程五个学术型硕士点和航空工程、航天工程两个工程硕士点。

飞行器工程学院成立以来，切实遵循“日新自强、知行合一”的校训，始终坚持“一心一意育人才，千方百计谋发展”的办学理念，坚持人才培养工作中心不动摇，坚持教学、科研协调发展不动摇，重视学生“知识、能力、素质”培养和锻炼，为江西地方和航空航天及国防工业培养了大批专业技术人才。